Search results for "kinētiskā modelēšana"
showing 2 items of 2 documents
MEP metaboliskā ceļa matemātiskā modeļa izveide izoprēna un cis-abienola ražošanai Tāla sīkplikstiņā
2018
Darbā apskatīta sistēmbioloģijas pieeja augu biotehnoloģijai, tās nozīme un priekšrocības eksperimentālo un modelēšanas metožu apvienošanai. Šī darba ietvaros izveidots matemātiskais modelis MEP metaboliskā ceļa un izoprenoīdu prekursoru sintēzes kinētikai tāla sīkplikstiņa savvaļas formā ar tālāko mērķi to izmantot izoprēna un cis-abienola biosintēzes ceļu optimizācijai. Darba ietvaros tika veikta parametru novērtēšana, stacionārā stāvokļa noteikšana un parametru jutības analīze, pielāgojot modeļa darbību eksperimentālajiem datiem. Darba ietvaros izmēģinātas iespējas samazināt parametru novērtēšanas risinājumu telpu, aprēķinot bioloģiski atbilstošas robežvērtības un genoma mēroga stehiomet…
Crypthecodinium cohnii metabolisma matemātiskā modelēšana DHA ražošanas optimizācijai
2020
Datormodelēšana un bioķīmisko ceļu simulēšana ir sistēmbioloģijas pamatnostādnes, un pastāv vairākas metodes, kas var palīdzēt šo sistēmu izpētīšanā. Darbā izmantota divu sistēmbioloģijas modelēšanas metožu pieeja šūnu taukskābju sintēzes metabolisma pētīšanai. Darba ietvaros izveidots kinētiskais modelis, kas ietver glikolīzes ceļa reakcijas un reakcijas, kas ved līdz taukskābju sintezējošajam enzīmam- FAS, kā arī pilnveidots genoma izmēra metaboliskais modelis dinoflagellātam Crypthecodinium cohnii. Kinētiskais modelis tika parametrizēts saskaņā ar pieejamajiem eksperimentālajiem datiem. Aplūkoti stehiometriskajā modelī ietvertie metabolisma regulācijas mehānismi taukskābju sintēzei un ga…